副猪嗜血杆菌病和链球菌病都是保育仔猪的常见疾病，而且二者都会导致仔猪的脑炎和关节炎等相类似的症状，经验不足的养殖户很容易诊断错误，进而导致用药错误，而延误治疗时机造成格外的经济损失。若想鉴别诊断副猪嗜血杆菌和链球菌，养猪人可以通过如下3个要点进行着手：
根据肿大关节状态
虽说副猪嗜血杆病和链球菌病都会导致病猪关节炎症状，但是二者导致的关节炎有明显的区别，因为两种疾病导致的肿大关节中的积液不同，所以肿大关节的状态也不同:
1）副猪嗜血杆菌。副猪嗜血杆菌导致的肿大关节中充满了胶冻样物质，所以摸起来是硬的，而且因为不属于炎症反应，所以肿大关节处没有红肿和发热的感觉，手摸同正常体温温度相近。
2）链球菌。链球菌导致的肿大关节中充满了脓性物质，所以摸起来是软的，而且因为属于炎症反应，所以肿大关节处有红肿和发热感觉，也就是摸起来的温度比正常皮肤温度要高。
根据病猪内脏病理变化
两病之间因为病原不同，发生疾病后的病理变化也有明显的不同。所以对两种疾病除了可以根据肿大关节状态进行鉴别诊断之外，还可以通过病猪内脏的病理变化进行疾病的确诊。
1）副猪嗜血杆菌。副猪嗜血杆菌引起的病猪内脏病变主要是各种组织的浆膜面，可见浆液性和化脓性纤维蛋白渗出物，包括腹膜、心包膜、胸膜、脑膜和关节表面的浆膜。
a、胸膜和腹膜病变。解剖副猪嗜血杆菌病猪，可在胸腹腔中发现大量的积液和纤维素性渗出，严重时肺脏、胃、肠道、肝脏等脏器都被纤维素蛋白渗出物所包裹。b、心包膜。副猪嗜血杆菌病有一个示病症状就是病猪心脏上被覆大量纤维素性渗出，俗称“绒毛心”，发现这一临床症状后即可做出准确诊断。2）链球菌。链球菌会导致病猪多种内脏发生病理变化，但是肝脏、脾脏、淋巴结和心脏病变比较严重。
a、心脏。链球菌会导致病猪心包液增多，心肌柔软，色淡呈煮肉样。另外右心室扩张，心耳、心冠沟以及右心室内膜有出血点。b、肝脏。肝脏肿大，质硬。胆囊水肿、胆囊壁增厚。c、脾脏。感染链球菌病猪的脾脏明显肿大，甚至可达正常的3倍，脾脏呈灰红或者暗红色，包膜下有小出血点，边缘有出血梗死。d、淋巴结。链球菌会导致病猪的全身淋巴结水肿、出血，严重时呈大理石样变。
实验室检测
实验室检测一般作为一种疾病的最终确诊方案，而链球菌和副猪嗜血杆菌一个属于革兰氏阳性球菌，一个属于革兰氏阴性杆菌，可以通过细菌学检查和培养检查两种方法进行诊断。
1）细菌学检查。细菌学检查一般是通过对病猪体内的肝、脾、肾或心血制成涂片或触片，然后进行相应的染色，并根据染色结果得出最终的结论。
2）培养检查。就是通过对病猪体内分离的细菌通过各种特异性培养基进行检测，比如链球菌可以在血液琼脂培养基中长出灰白色、透明、湿润黏稠、露珠状的菌落。
链球菌病和副猪嗜血杆菌病的防控
因为二者都属于细菌性疾病，而且血清型众多，使用疫苗免疫效果并不理想，所以其防控主要依赖于抗生素。
1）副猪嗜血杆菌。副猪嗜血杆菌属于典型的条件致病菌，当健康猪受到寒冷等因素应激时或者感染蓝耳病、圆环病毒病等免疫抑制性疾病时就很容易引起副猪嗜血杆菌病的发生。副猪嗜血杆菌病的防控需要注意：
a、做好蓝耳、圆环、伪狂犬和支原体等病的防控；b、提高猪场硬件设施，降低仔猪断奶应激；c、选择敏感药物。2）链球菌。链球菌不同于副猪嗜血杆菌，不仅会继发于病毒性疾病，还可以作为原发疾病发生，所以猪场内链球菌的发病率要高于副猪嗜血杆菌病。链球菌的防控需要注意：
a、仔猪剪牙、断尾等有外伤的操作时需要注意操作流程，做好消毒；b、仔猪链球菌病的高发日龄为3-4周龄仔猪，所以建议仔猪断奶时饲料中即加入敏感抗生素。